iMed వినియోగదారు మాన్యువల్

పరిచయం

1.1 ప్రయోజనం
దీని ఉద్దేశ్యం web అప్లికేషన్ అనేది ముడి సమాచారాన్ని తీసుకోవడం మరియు నిర్ణయం తీసుకోవడంలో ఉపయోగకరమైన ఫలితాలను ఇచ్చే పద్ధతిలో దానిని మార్చడాన్ని అనుమతించడం. ఇది ముడి డేటాతో మోడల్‌కు శిక్షణ ఇవ్వడం లేదా మోడల్‌లు మరియు విశ్లేషణలను ఉపయోగించి ఫలితాన్ని అంచనా వేయడం కావచ్చు.
1.2 నావిగేషనల్ మెనూ
పేజీ ఎగువన ఉన్న నావిగేషనల్ మెను మీరు ఉండాల్సిన చోటికి చేరుకోవడానికి అన్ని లింక్‌లను కలిగి ఉంటుంది. మీరు ఎప్పుడైనా తప్పిపోయినట్లయితే, మీకు తెలిసిన పేజీని పొందడానికి, ఇంటికి తిరిగి వెళ్లడానికి లేదా నావిగేషనల్ మెనులో మీరు వెతుకుతున్న పేజీని కనుగొనడానికి మీరు ఎల్లప్పుడూ వెనుక బాణంపై క్లిక్ చేయవచ్చు.
1.3. ఖాతా
మీకు ఇప్పటికే ఖాతా లేకుంటే, అప్లికేషన్‌ను ఉపయోగించడానికి మీరు తప్పనిసరిగా నమోదు చేసుకోవాలి. అలా చేయడానికి, ఎగువ కుడి వైపున ఉన్న ఖాతా బటన్‌ను క్లిక్ చేసి, నమోదు క్లిక్ చేయండి. ఆపై కొనసాగడానికి మీ వినియోగదారు పేరు, పాస్‌వర్డ్ మరియు ఇమెయిల్‌ను నమోదు చేయండి.

మీకు ఇప్పటికే ఖాతా ఉంటే, మీ వినియోగదారు పేరు మరియు పాస్‌వర్డ్‌తో సైన్ ఇన్ చేయండి.

హోమ్ పేజీ

పేజీ యొక్క ఎడమ వైపున ఉన్న ఐటెమ్‌లపై క్లిక్ చేయడం ద్వారా, ప్రతి ఒక్కటి ఏమి చేస్తుందో అర్థం చేసుకోవడంలో మీకు సహాయం చేయడానికి ప్రతిదాని యొక్క వివరణ పేజీ మధ్యలో కనిపిస్తుంది.

iMedBot

iMedBot అప్లికేషన్ ఏజెంట్‌లతో సులభమైన వినియోగదారు పరస్పర చర్యను ప్రోత్సహించే ఇంటర్‌ఫేస్‌ను అందిస్తుంది, వ్యక్తిగతీకరించిన అంచనా మరియు మోడల్ శిక్షణను అనుమతిస్తుంది. డీప్ లెర్నింగ్ రీసెర్చ్ ఫలితాలను ఆన్‌లైన్ సాధనంగా మార్చడానికి ఇది మొదటి అడుగుగా పనిచేస్తుంది, ఈ డొమైన్‌లో అదనపు పరిశోధనా కార్యకలాపాలను ప్రారంభించే అవకాశం ఉంది. దాని సంబంధిత వినియోగదారు మాన్యువల్ ఇక్కడ చూడవచ్చు.

డేటా విశ్లేషణ

4.1 ఉపసమితులను తిరిగి పొందండి
ఈ విభాగం వినియోగదారు వారి డేటాసెట్‌ను సవరించడానికి అనుమతిస్తుంది. మీరు డ్రాప్-డౌన్ మెను నుండి కొత్త డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేయడాన్ని ఎంచుకోవచ్చు లేదా ఇప్పటికే ఉన్నదాన్ని ఉపయోగించవచ్చు.

డేటాసెట్ అప్‌లోడ్ చేయబడిన తర్వాత, ఎడమ వైపు మెనులో ఉన్న ఎంపికలలో ఒకదానిని క్లిక్ చేయడం ద్వారా మీరు ఏ చర్య తీసుకోవాలనుకుంటున్నారో ఎంచుకోవచ్చు.
4.1.1 ఫిల్టర్‌ల ఆధారంగా ఉపసమితులను తిరిగి పొందండి
ఈ విభాగం ఇచ్చిన ఫిల్టర్‌ల ఆధారంగా అసలు డేటాసెట్ యొక్క చిన్న ఉపసమితిని పొందడానికి అనుమతిస్తుంది. ఉపసమితిలో మీకు కావలసిన విలువలను ఎంచుకుని, చివరి డేటాసెట్‌లో మీరు చూపాలనుకుంటున్న నిలువు వరుసలను ఎంచుకోండి.

4.1.2 క్రమబద్ధీకరించబడిన ఫలితాలను తిరిగి ఇవ్వండి
ఇది డేటాసెట్‌ను క్రమబద్ధీకరించిన రూపంలో అందిస్తుంది. లక్ష్య నిలువు వరుస, క్రమబద్ధీకరణ క్రమం, తిరిగి రావాల్సిన అడ్డు వరుసల సంఖ్య మరియు తుది అవుట్‌పుట్‌లో ఏ నిలువు వరుసలను చూపించాలో ఎంచుకోండి.

4.1.3 డేటాసెట్‌ను విస్తరించండి
డిక్షనరీగా నిల్వ చేయబడిన ఏకవచన నిలువు వరుసను వినియోగదారుడు మార్చగలిగే వాస్తవ పట్టికగా విస్తరించడానికి ఇది వినియోగదారుని అనుమతిస్తుంది. ఇది సమూహ డేటాసెట్‌ను తీసుకుంటుంది మరియు వినియోగదారుకు అవసరమైన వాటిని టాప్-మోస్ట్ లేయర్‌లోకి తరలిస్తుంది. ముందుగా, సమూహ డేటాసెట్‌తో నిలువు వరుసను కలిగి ఉన్న డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేయండి. విస్తరించాల్సిన కాలమ్ స్వయంచాలకంగా గుర్తించబడితే, ఏ నిలువు వరుసను విస్తరించాలో మరియు సమూహ సమాచారం నుండి ఏ నిలువు వరుసలను సంగ్రహించాలో ఎంచుకోండి. సమర్పించు క్లిక్ చేయండి మరియు మీరు చేయవచ్చు view మీ సమాచారం సమూహ డేటాకు బదులుగా పట్టిక నిలువు వరుసలుగా ఉంటుంది.
4.2. విలీనం Files
ctrl క్లిక్ చేయడం ద్వారా బహుళ డేటాసెట్‌లను ఎంచుకోవడం మరియు అప్‌లోడ్ చేయడం ద్వారా (mac కోసం కమాండ్), ఇది వాటిని వేరొకదానికి ఉపయోగించడం కంటే పెద్ద డేటాసెట్‌లో విలీనం చేస్తుంది.

అన్ని డేటాసెట్‌లను ఎంచుకుని, అవసరమైన సమాచారాన్ని పూరించండి. ఇది కొత్త డేటాసెట్‌ను iMed అప్లికేషన్‌లో సేవ్ చేస్తుంది మరియు డౌన్‌లోడ్ చేసుకోవడానికి అందుబాటులో ఉంటుంది.
4.3 ప్లాట్ విధులు
ఈ విభాగం వినియోగదారు వారి డేటాసెట్‌ను ప్లాట్ చేయడానికి అనుమతిస్తుంది. ఎడమ వైపు మెనులో ఎంపికలలో ఒకదాన్ని ఎంచుకుని, ఆపై మీ ప్లాట్‌ను పొందడానికి అవసరమైన ఫీల్డ్‌లను పూరించండి. మీ డేటా నుండి మీరు తయారు చేయగల ప్లాట్ల రకాలు క్రింద ఉన్నాయి:

4.4 గణాంక విశ్లేషణ
ఈ విభాగం మా డేటాసెట్‌లో గణాంక పరీక్షలను అమలు చేయడానికి అనుమతిస్తుంది. ఎడమ వైపు మెను నుండి అమలు చేయడానికి పరీక్షను ఎంచుకోండి మరియు పరీక్షలను అమలు చేయడానికి ఫీల్డ్‌లను పూరించండి. అందుబాటులో ఉన్న పరీక్షల రకాలు క్రింద ఉన్నాయి:

ODPAC

5.1 నేర్చుకో
ఈ పేజీలో ఈ పేజీలో అందుబాటులో ఉన్న ప్రతి రకమైన వనరుల క్లుప్త వివరణ ఉంటుంది. ప్రతి విభాగం ఎగువన ఉన్న బటన్‌ను క్లిక్ చేయడం ద్వారా వినియోగదారుని ఉపయోగించడానికి లేదా అంశాన్ని గురించి మరింత తెలుసుకోవడానికి మరొక పేజీకి లింక్ చేయబడుతుంది.
5.1.1 ఎపిస్టాసిస్
డేటా నుండి తెలుసుకోవడానికి శోధన అల్గారిథమ్ అయిన MBSని ఉపయోగించడానికి ఈ పేజీ మమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. ప్రత్యేకంగా, ఇది సమలక్షణాన్ని ప్రభావితం చేసే రెండు లేదా అంతకంటే ఎక్కువ జన్యువుల మధ్య పరస్పర చర్య అయిన ఎపిస్టాసిస్‌ను అధ్యయనం చేయడానికి అనుమతిస్తుంది. ఇది ప్రోకు ఉపయోగపడుతుందిfile జన్యుపరమైన అంశంలో వ్యాధులు. జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీస్ (GWAS)లో కనిపించే హై-డైమెన్షనల్ డేటాను నిర్వహించడానికి సంప్రదాయ పద్ధతులు సరిపోవు. మల్టిపుల్ బీమ్ సెర్చ్ (MBS) అల్గారిథమ్ ఇంటరాక్టింగ్ జన్యువులను చాలా వేగంగా గుర్తించడానికి అనుమతిస్తుంది. మీరు ఉపయోగించాలనుకుంటున్న డేటాను అప్‌లోడ్ చేసి, ఆపై అవసరమైన ఫీల్డ్‌లను ఇన్‌పుట్ చేయండి. మరింత లోతైన సమాచారం కోసం, పూర్తి కాగితాన్ని ఇక్కడ కనుగొనండి.

5.1.2. ప్రమాద కారకాలు
డేటా మధ్య పరస్పర చర్యలను తెలుసుకోవడానికి ఈ పేజీ మమ్మల్ని IGain ప్యాకేజీని ఉపయోగించడానికి అనుమతిస్తుంది. ఇది ప్రత్యేకంగా హ్యూరిస్టిక్ శోధనను ఉపయోగించి హై-డైమెన్షనల్ డేటా నుండి పరస్పర చర్యలను నేర్చుకుంటుంది. ఈ పద్ధతి తక్కువ డైమెన్షనల్ డేటా నుండి పరస్పర చర్యలను తెలుసుకోవడానికి గతంలో అభివృద్ధి చేసిన Exhaustive_IGain పద్ధతిపై రూపొందించబడింది. డేటాను అప్‌లోడ్ చేసి, ఆపై అవసరమైన ఫీల్డ్‌లను ఇన్‌పుట్ చేయండి. IS థ్రెషోల్డ్‌లు మరియు iGain గురించి మరింత సమాచారం ఇక్కడ చూడవచ్చు.

5.1.3 ప్రిడిక్షన్ మోడల్స్
ఈ విభాగం దాని వినియోగాన్ని వేగవంతం చేయడానికి మెషిన్ లెర్నింగ్ మోడల్‌ల పైన ఇప్పటికే ముందుగా నిర్మించిన ప్రిడిక్షన్ మోడల్‌ల వినియోగాన్ని అనుమతిస్తుంది. ఇది వారి స్వంత డేటాసెట్‌ని ఉపయోగించి మోడల్‌లను అంచనా వేయడానికి కోడింగ్ మరియు ముందస్తు అనుభవం లేకుండా వారి వినియోగాన్ని అనుమతిస్తుంది. లాజిస్టిక్, రిగ్రెషన్, సపోర్ట్ వెక్టర్ మెషీన్‌లు (SVMలు), డెసిషన్ ట్రీలు మరియు మరెన్నో సహా అనేక ప్రిడిక్షన్ మోడల్‌లు వినియోగదారుకు అందుబాటులో ఉన్నాయి. అంచనా పద్ధతుల యొక్క పూర్తి జాబితా ఇక్కడ పేజీ యొక్క కుడి వైపున కనుగొనబడింది.
5.2. అంచనా
ఈ విభాగం గతంలో అప్‌లోడ్ చేసిన భాగస్వామ్య మోడల్ నుండి అంచనాలను అనుమతిస్తుంది. భాగస్వామ్య మోడల్‌ను ఇప్పటికే అప్‌లోడ్ చేయకపోతే ముందుగా అప్‌లోడ్ చేయండి. ఆపై మోడల్ పేరును క్లిక్ చేయడం ద్వారా అంచనా కోసం ఉపయోగించాల్సిన మోడల్‌ను ఎంచుకోండి. తర్వాత ప్రిడిక్షన్ మోడల్‌ను ఉపయోగించేందుకు డేటాను అప్‌లోడ్ చేయండి. ఇది పేజీ దిగువన ఉన్న ఫారమ్‌ను ఉపయోగించి లేదా డౌన్‌లోడ్ చేయడానికి అందుబాటులో ఉన్న టెంప్లేట్‌ను ఉపయోగించి మాన్యువల్‌గా చేయవచ్చు. టెంప్లేట్‌ని ఉపయోగిస్తుంటే, డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేయండి file మరియు మోడల్ ప్రిడిక్షన్‌ని అందుకోవడానికి సమర్పించు క్లిక్ చేయండి.
5.3 నిర్ణయం మద్దతు
నిర్ణయ మద్దతు వర్గీకరణను అందిస్తుంది మరియు సిస్టమ్‌కు అందించబడిన సమాచారం నుండి చికిత్స ఎంపికలకు మార్గనిర్దేశం చేస్తుంది. రోగి యొక్క లక్షణాల ఆధారంగా సరైన చికిత్స విధానాన్ని సిఫార్సు చేయడానికి ఇది డేటా నుండి శిక్షణ పొందింది. క్లినికల్ డెసిషన్ సపోర్ట్ సిస్టమ్స్ (CDSS) గురించి మరింత సమాచారం ఇక్కడ చూడవచ్చు.
సిస్టమ్ సిఫార్సు రోగి యొక్క లక్షణాలను తీసుకుంటుంది మరియు చికిత్స విధానాన్ని సిఫార్సు చేస్తుంది మరియు 5 సంవత్సరాల మెటాస్టాసిస్ యొక్క భవిష్యత్తు సంభావ్యతను అంచనా వేస్తుంది. సరైన చికిత్సకు బదులుగా ప్రస్తుత చికిత్స ఆధారంగా 5 సంవత్సరాల మెటాస్టాసిస్ యొక్క భవిష్యత్తు సంభావ్యతను అంచనా వేయడానికి వినియోగదారు జోక్యం రోగి లక్షణాలు మరియు చికిత్సా విధానం రెండింటినీ తీసుకుంటుంది.

MBIL

మార్కోవ్ బ్లాంకెట్ మరియు ఇంటరాక్టివ్ రిస్క్ ఫ్యాక్టర్ లెర్నర్ (MBIL) అనేది రోగి యొక్క ఫలితంపై ప్రత్యక్ష ప్రభావాన్ని చూపే సింగిల్ మరియు ఇంటరాక్టివ్ రిస్క్ కారకాలను నేర్చుకునే అల్గారిథమ్. ఇక్కడ ఉన్న MBIL ప్యాకేజీ కోసం పైథాన్ ప్యాకేజీ సూచిక (PyPI)కి దారి మళ్లించడానికి "MBILకి వెళ్లు" క్లిక్ చేయండి. MBIL గురించి మరింత సమాచారం BMC బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్‌లో చూడవచ్చు.

డేటాసెట్‌లు

ఈ విభాగం వినియోగదారుని కొత్త డేటాసెట్‌లను చూడటానికి మరియు అప్‌లోడ్ చేయడానికి అనుమతిస్తుంది web అప్లికేషన్.
7.1 అందుబాటులో ఉన్న అన్ని డేటాసెట్‌లను చూడండి
అందుబాటులో ఉన్న అన్ని డేటాసెట్‌లను చూడటానికి, “అందుబాటులో ఉన్న డేటాసెట్‌లను చూపు” క్లిక్ చేయండి.

7.2 డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేయండి
డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేయడానికి, “మీ డేటాసెట్‌లను భాగస్వామ్యం చేయండి” క్లిక్ చేసి, ఆపై పేర్కొన్న విధంగా అవసరమైన సమాచారాన్ని పూరించండి webపేజీ. ముందుగా, డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేసి, అవసరమైన ఫీల్డ్‌లను పూరించండి.

ఆపై, దిగువ ఫీల్డ్‌లను పూరించండి లేదా వచనాన్ని అప్‌లోడ్ చేయండి file నింపిన సమాచారంతో. ఒక మాజీampఅప్లికేషన్ అర్థం చేసుకోగలిగేలా సమాచారాన్ని ఎలా ఆర్గనైజ్ చేయాలో క్రింద ఇవ్వబడింది.

మోడల్స్

ఈ విభాగం వినియోగదారు తమకు అందుబాటులో ఉన్న మోడల్‌లను చూడటానికి మరియు మోడల్‌ను భాగస్వామ్యం చేయడానికి అనుమతిస్తుంది.
8.1 అందుబాటులో ఉన్న అన్ని మోడల్‌లను చూడండి
అందుబాటులో ఉన్న అన్ని మోడల్‌లను చూడటానికి, "అందుబాటులో ఉన్న మోడల్‌లను చూపు" క్లిక్ చేయండి.

8.2 మోడల్‌ను భాగస్వామ్యం చేయండి
మోడల్‌ను షేర్ చేయడానికి, "షేర్ యువర్ మోడల్స్"పై క్లిక్ చేసి, ఆపై మోడల్‌ను అప్‌లోడ్ చేయండి file టెన్సర్ ఫ్లో లేదా పైటార్చ్ ద్వారా శిక్షణ పొందారు.

8.2.1 సంబంధిత డేటాసెట్
మీరు హెడర్‌లను కలిగి ఉన్న సంబంధిత డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేయాలి. డేటాసెట్ కోసం క్లాస్/లేబుల్ చివరి నిలువు వరుసలో ఉండాలి.

8.2.2 ప్రిడిక్టర్లు మరియు తరగతి సమాచారం
డేటాసెట్‌లో అన్ని ఫీచర్లు ఉంటే, డేటాసెట్‌ను అప్‌లోడ్ చేసిన తర్వాత ఫీచర్ ఫారమ్‌ను దాటవేయవచ్చు. అయినప్పటికీ, అవన్నీ చేర్చబడకపోతే, ఈ సమాచారాన్ని తప్పనిసరిగా వివరణలో అందించాలి file లేదా ఫీచర్ రూపంలో. మీరు ప్రిడిక్టర్లు మరియు తరగతి సమాచారాన్ని ఎలా అందించాలనుకుంటున్నారో సూచించే డ్రాప్ డౌన్ నుండి ఎంపికను ఎంచుకోండి.

వివరణ ఎంపికను ఉపయోగిస్తుంటే, మీరు ఫీల్డ్‌లను పూరించవచ్చు లేదా వచనాన్ని అప్‌లోడ్ చేయవచ్చు file నింపిన సమాచారంతో. ఒక మాజీampసమాచారాన్ని ఎలా నిర్వహించాలో క్రింద ఇవ్వబడింది.

పత్రాలు / వనరులు

యాప్‌లు iMed Web అప్లికేషన్ [pdf] యూజర్ మాన్యువల్ iMed, iMed Web అప్లికేషన్, Web అప్లికేషన్

సూచనలు

• వినియోగదారు మాన్యువల్